Budowana druga jezdnia drogi S-3 biegnie równolegle do lewej jezdni obwodnicy, wybudowanej w etapie I i II - będzie zatem przecinać sieci komunikacyjne analogicznie do niej:
- km 1+000 droga wojewódzka nr 130 Barnówko - Baczyna, (ul. Szczecińska) - Węzeł Gorzów Północ
- km 1+814 ul. Małyszyńska (przecięcie – kładka dla pieszych)
- km 2+741 droga gospodarcza (przecięcie)
- km 4+470 linia kolejowa Gorzów Wlkp. - Myślibórz (linia nieczynna, do likwidacji)
- km 4+518 droga wojewódzka nr 132 Kostrzyn - Gorzów (Węzeł Gorzów Centrum)
- km 4+923 linia kolejowa Tczew - Kostrzyn
- km 5+169 droga gminna, ul. Dolna (przecięcie)
- km 6+151 droga powiatowa, ul. Wiśniowa (przecięcie)
- km 7+884 droga gminna, ul. Półwiejska (przecięcie)
- km 10+108 droga krajowa nr 22, ul. Kasprzaka (Węzeł Gorzów Południe).
Realizowana druga jezdnia obwodnicy, wpływa na istniejącą sieć drogową poprzez rozbudowę węzłów drogowych.